Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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