Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fam208bQ5DTT3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms