Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eme2Q56A04 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms