Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm12888Q3UW77 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms