Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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D130052B06RikQ3UW13 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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