Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Srsf6Q3TWW8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms