Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms