Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Traf3ip1Q149C2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms