Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF5Q12774 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF5Q12774 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms