Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CartptP56388 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CartptP56388 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CartptP56388 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CartptP56388 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CartptP56388 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CartptP56388 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CartptP56388 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CartptP56388 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CartptP56388 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CartptP56388 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CartptP56388 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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CartptP56388 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms