Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms