Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprqP0C5E4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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