Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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TtrP07309 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TtrP07309 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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