Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M1F7CXU4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms