Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkab1Q9R078 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms