Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc97Q9DBT3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc97Q9DBT3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc97Q9DBT3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc97Q9DBT3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc97Q9DBT3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc97Q9DBT3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc97Q9DBT3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc97Q9DBT3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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