Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms