Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CICQ96RK0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CICQ96RK0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms