Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc39cQ8VE09 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc39cQ8VE09 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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