Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BbxQ8VBW5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BbxQ8VBW5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BbxQ8VBW5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BbxQ8VBW5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BbxQ8VBW5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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