Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfr1Q8BP27 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sfr1Q8BP27 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfr1Q8BP27 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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