Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Smim19Q80ZU4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms