Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms