Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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