Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms