Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usf1Q61069 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usf1Q61069 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usf1Q61069 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf1Q61069 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usf1Q61069 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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