Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms