Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms