Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hdgfl2Q3UMU9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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