Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf149Q3U2C5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnf149Q3U2C5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rnf149Q3U2C5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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