Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEUROD1Q13562 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD1Q13562 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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