Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
AmbpQ07456 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms