Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp20P57748 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms