Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Map3k1P53349 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Map3k1P53349 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms