Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cap1P40124 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cap1P40124 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms