Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms