Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms