Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxb1P17919 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxb1P17919 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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