Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxd2O35392 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms