Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms