Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rrn3B2RS91 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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