Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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