Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms