Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms