Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myom3A2ABU4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms