Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r25W4VSP2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r25W4VSP2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r25W4VSP2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms