Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vstm4T1NXB5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vstm4T1NXB5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms