Protein–RNA interactions for Protein: S4R213

Lactbl1, Lactamase, beta-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactbl1S4R213 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lactbl1S4R213 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lactbl1S4R213 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lactbl1S4R213 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms