Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uso1Q9Z1Z0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uso1Q9Z1Z0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uso1Q9Z1Z0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uso1Q9Z1Z0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms