Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clic1Q9Z1Q5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clic1Q9Z1Q5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clic1Q9Z1Q5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms